Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms