Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms