Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms