Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PpifQ99KR7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PpifQ99KR7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PpifQ99KR7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PpifQ99KR7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms