Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rab28Q99KL7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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