Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms