Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms