Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Dok4Q99KE3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Dok4Q99KE3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Dok4Q99KE3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Dok4Q99KE3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Dok4Q99KE3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Dok4Q99KE3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Dok4Q99KE3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dok4Q99KE3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dok4Q99KE3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dok4Q99KE3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dok4Q99KE3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dok4Q99KE3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dok4Q99KE3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms