Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdxdc1Q99K01 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms