Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Krcc1Q99JT5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Krcc1Q99JT5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Krcc1Q99JT5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krcc1Q99JT5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krcc1Q99JT5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krcc1Q99JT5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krcc1Q99JT5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Krcc1Q99JT5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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