Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan1Q99J59 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms