Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms