Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lmo1Q924W9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms