Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim66Q924W6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim66Q924W6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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