Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms