Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms