Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms