Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms