Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms