Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms