Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms