Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms