Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TgdsQ8VDR7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TgdsQ8VDR7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TgdsQ8VDR7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TgdsQ8VDR7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TgdsQ8VDR7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms