Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms