Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx2ipQ8VC66 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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