Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms