Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf4Q8R368 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms