Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Impg1Q8R1W8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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