Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Hoxc12Q8K5B8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Hoxc12Q8K5B8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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