Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolbQ8K409 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms