Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OptnQ8K3K8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms