Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrrdQ8K2M3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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