Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6bQ8K2H2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms