Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms