Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hacd3Q8K2C9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd3Q8K2C9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms