Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Scara5Q8K299 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scara5Q8K299 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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