Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Trim68Q8K243 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Trim68Q8K243 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trim68Q8K243 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trim68Q8K243 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim68Q8K243 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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