Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms