Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms