Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms