Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms