Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms