Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE3

Rcor1, REST corepressor 1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcor1Q8CFE3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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