Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Hpf1Q8CFE2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Hpf1Q8CFE2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Hpf1Q8CFE2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Hpf1Q8CFE2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hpf1Q8CFE2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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