Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms