Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms