Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms