Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms