Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ubqln3Q8C5U9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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