Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc113Q8C5T8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc113Q8C5T8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc113Q8C5T8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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